有机农场应选择隔离地区，以避免一般化学栽培喷洒农药之污染。为防止上游之污染源导入灌溉水，有机农场之水源以独立使用为原则。否则应钻深水井，抽水灌溉。以免上游化学农药及肥料成为污染源，而污染有机农场土壤。同时也要考虑土壤是否残留毒物。基本上，选择一个与外界有天然屏障隔离，有独立水源，且未遭受污染的土地，用来经营有机农场，是最省事的办法。但是这样的条件，在国内并不容易找到。退而求其次，则需要建构人为的屏障，例如用高大的绿篱来阻隔外界的污染源，但仍需相当的隔离距离。

　　隔离不只要注意防止空气和水源的污染入侵，也要防止杂草种子、病虫害及有害生物，诸如福寿螺的入侵，所以在入水口及出水口处应设法装置纱网，可以减少杂草和病虫害的防治费用。

　　如果找不到隔离的农场，另外一个最好的办法，就是劝导邻近的地主，大家一起来推行有机农法。如果能够邀集整个灌溉流域，或者整个村庄的农民，大家一起从事有机农业，那更是功德无量。对整个大环境的天然资源保育，以及大片土地的永续利用，都可以获得更好的结果。所以找不到隔离环境和独立水源的人，也不必悲观。或许花一点心力，说服邻近的地主，鼓励大家一起来从事有机栽培。互相切磋，可能更容易达到目标，也成就更大的功德。

　　在台湾经营农场选择土壤，首先应考虑土壤排水等物理性质。台湾由于雨水量大集中，往往造成土壤排水不良。长时间处于通气不良情况，作物根系环境恶劣，生育不良，往往造成有机农场之经营困难。所以选择有机农场，应以土壤排水良好为第一优先考虑。排水较差土壤，可以考虑做为有机水稻生产之用。但严重排水不良土壤，即使种植水稻也不适宜，必需事先改良排水，才能从事农耕。

　　近数十年来化学农业的发展，机械化与化学物质之大量投入。土壤贫瘠，水资源污染，生物多样性丧失。因此造成许多问题，威胁到国家社会之安全与生存。资本主义重视经济效率，农业生产必须大规模的集约经营，否则就无利可图。有机农业事实上是违反此一原则的，它并不依照生产的便利及利润的追求，来生产农产品。配合植物生理，依循自然的生态与法则。依据市场经济法则，会有许多害处：

　　(1)偏重经济价值较高之作物，常违反大自然的法则，进行不合理栽培，以致到最后不使用化学物质就无法栽培。

　　(2)特殊农产品的生产，近代农业之经营，看起来赚钱，却也有很大的陷阱，就是生产成本逐渐提高。农产品为低需求弹性之商品，为使其能在市场持续出货，往往陷于削价竞卖之命运。显然农业上提高生产成本是一种自杀式的行为，而且特殊农产品随时就可能变成为普通产品，只好再改变转而生产其它高价值农产品。新产品因成本高，除非能高价出售，否则无以为继。形成恶性循环，不知不觉中将农业经营导入可怕的泥沼。

　　将农产品当作商品其实是一种错误，生产者不知道谁要食用他生产的农产品，消费者也不知道食用的是谁生产的食物，其间缺乏善良人性的介入，则问题永远存在。

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